El Acuario es el único museo marino situado en Alejandría. Se fundó en 1969, y lo que lo distingue es que está cerca de la Ciudadela de Qaitbay, y su visita es algo interesante porque está cerca del castillo.
El Acuario incluye varios tipos de peces, reptiles, fósiles y animales marinos raros del Mediterráneo y el Mar Rojo, y de aguas dulces como los ríos Nilo y Amazonas. También incluye aves acuáticas disecadas como cisnes, flamencos y gaviotas.
Consta de: El museo tiene dos salas que contienen 32 cuencas de diversos tamaños determinados por el número, tipo y tamaño de los peces y los organismos marinos que viven para proporcionar un entorno adecuado. Hay muchas especies de peces que varían en su hábitat nativo y en las condiciones ambientales. Además de las cuencas, se dispone de información científica sobre cada especie de pez, en cuanto a su nombre científico, los alimentos que consume y el lugar donde se encuentra.
Tiene los cuerpos y estructuras de varios peces disecados, como peces luna, animales marinos, arrecifes de coral de fantásticos colores y peces raros, dentro de acuarios de cristal. Y paredes de piedra con luces que reflejan los colores de los peces y los arrecifes de coral, y en el techo del museo hay una enorme ballena momificada, y cuando la miras, parece que está viva y nadando en el aire y entre las paredes. Esta ballena fue encontrada en la playa de Azure, en el Mediterráneo, en 2018. El Instituto Nacional de Oceanografía lo momificó para unirse a los organismos marinos momificados. La momificación fue realizada por manos egipcias, utilizando unas 5 toneladas de sal y 5 toneladas de gansos vivos para su conservación. Contiene muchos laboratorios, una biblioteca y grandes cuencas para diversas plantas y animales de los mares.