Sua Santità Papa Cirillo (Kyrillos) VI morì il 9 marzo 1971 e fu sepolto sotto l'altare della cattedrale. Il 25 novembre 1972, il suo corpo fu trasferito con una cerimonia solenne nel monastero del martire San Menes a Meriut, secondo il suo desiderio di essere accanto al suo patrono Menes.
L'area archeologica di Deir Menes è stata registrata dall'UNESCO tra le aree archeologiche più importanti. Nel 1979, l'UNESCO ha prestato particolare attenzione al sito archeologico di Abu Mina e lo ha approvato tra le 57 aree come patrimonio umano che deve essere curato e preservato a livello globale. A questo proposito, nel 1982 ha pubblicato un libro che contiene una breve descrizione di ciascuno dei La storia del monastero risale all'arrivo dei resti del martire "San Menes" e al loro insediamento nel suo antico santuario di antichità intorno al 312-315.
La prima chiesa del martire di Meriot fu costruita tra il 320 e il 325 d.C., durante il regno di Costantino il Grande, e il numero di visitatori e cercatori di miracoli aumentò.
Quando il numero di visitatori aumentò, il vescovo Teofilo, papa 23°, costruì una vasta cattedrale a est della prima chiesa. Ristrutturò e ampliò anche la prima chiesa e costruì un grande battistero a ovest.
La città, con le sue chiese, divenne ambita dagli stranieri e dalle incursioni dei turchi berberi e persiani, finché nel XIII secolo la città e le sue chiese si estinsero a causa degli ampi atti di vandalismo che la colpirono e della mancanza di sicurezza in essa. In seguito, il corpo del martire San Menes fu trasferito attraverso un lungo viaggio da Mariout.
I ritrovamenti archeologici della zona iniziarono nel 1905 con il lavoro dello scienziato tedesco Kaufman, seguito da altre ricerche a intervalli del Museo greco-romano di Alessandria, del Museo copto del Cairo e di altri.
Durante il regno di Sua Santità Papa Cirillo VI, l'area su cui sorge il moderno monastero, completamente adiacente all'area archeologica, è stata acquistata e la ricostruzione è ricominciata e la sua superficie raggiunge i 15 acri.
Il santuario è separato dalla navata della chiesa da una parete cava che ospita circa 15 oggetti del Papa ed è chiusa da un vetro, per garantire la sicurezza dei visitatori. Si tratta di una croce d'argento con una pietra verde al centro, del suo orologio latente, che fu fermato con la sua morte alle undici meno un terzo, e del suo "make-three", che assomiglia a una cintura di cuoio contenente 12 croci. Il monaco lo indossa quando diventa autistico o quando avanza spiritualmente nel monastero e lo indossa dopo aver tenuto preghiere speciali.
Il suo proprietario è obbligato a sottostare alle eccessive leggi monastiche e ascetiche. I visitatori scrivono i loro ordini in un vaso in cima al mausoleo. Il numero di visitatori del monastero aumenta in occasione delle feste dei santi, dei giorni festivi ufficiali, e il venerdì e la domenica, dove entrano nel santuario spruzzando il segno della croce, e si dirigono velocemente dall'ingresso tribale al mare per prendere la benedizione, mentre alcuni di loro rimangono a lungo accanto al corpo del Papa, parlando dei loro problemi.
Il monastero conservava tre paia di scarpe per il Papa, ognuna delle quali variava a seconda della situazione. La prima è la scarpa di cuoio, che durava nel suo piede per anni inalterata, a causa del suo ascetismo nella vita, la seconda è la "pantofola" per i suoi movimenti interni ai monasteri tra i monaci, e la terza è la scarpa di stoffa dedicata alle preghiere