Nel 1856 giunse in Egitto un giovane siriano di nome "Gabriel Habib al-Sakakini", nato a Damasco nel 1841, che accettò un lavoro presso la Compagnia del Canale di Suez a Port Said. Suez, inviando pacchi di gatti affamati caricati su cammelli, eliminò il problema della diffusione dei ratti nell'area del Canale di Suez. Da allora, il khedive Ismail si affidò al giovane siriano e gli affidò la costruzione dell'Opera khediviana, che riuscì effettivamente a terminare in tempo il 17 novembre 1869; il khedive gli conferì il titolo di "Beck", dopodiché Habib Sakakini divenne uno dei maggiori appaltatori e nel marzo 1901 il Papa a Roma gli conferì il titolo di "conte" per i suoi servizi alla comunità.
Nel 1897, il Palazzo Sakakini fu costruito su uno stagno di terra chiamato "Qaraja al-Turkmani", o "Stagno di Qaraja", che gli era stato concesso nella zona di al-Zahir chiamata Sheikh Qamar. Il palazzo era di proprietà dello Stato e uno dei nipoti di Sakakini, che era medico, donò la sua parte al Ministero della Sanità.
Nel periodo 1961-1983, il palazzo divenne la sede del Museo dell'Educazione alla Salute; alla fine del periodo, dopo il trasferimento del museo dal palazzo, alcuni dei reperti del museo furono conservati nel seminterrato del palazzo, e nel 1987 il palazzo fu registrato come antichità islamica e copta con una decisione del Primo Ministro, per essere posto sotto gli auspici del Consiglio Supremo delle Antichità.
La superficie del palazzo è di circa 2698 metri quadrati ed è stato costruito in stile italiano, in quanto è considerato un modello per l'arte del "Rococò", un'arte che appartiene alla decorazione in architettura, alla decorazione interna ed esterna, così come ai mobili, alla fotografia e alla scultura, È un'arte che emana dall'involucro irregolare, e fu l'inizio della nascita di quest'arte in Francia nel XVIII secolo d.C., dove una società italiana lo costruì per essere una copia di un palazzo italiano che Habib al-Sakakini aveva visto e voleva imitare o farne una copia al Cairo.
Il palazzo è composto da 5 piani, il primo piano è composto da 4 stanze, il secondo da 3 sale, 4 sale e due stanze. La sala principale ha una superficie di circa 600 metri quadrati e contiene 6 porte che conducono alle sale del palazzo. Più di 400 finestre e porte e 300 statue, tra cui un busto di Habib Pasha al-Sakakini, si trovano in cima all'ingresso principale del palazzo. Il palazzo è dotato di un ascensore e si affaccia su un balcone con una cupola rotonda che conduce al salone estivo.
Attualmente, il palazzo soffre dell'incuria, dell'oblio, del caos di varie incursioni e dell'abbandono di rifiuti accanto ad esso, sebbene sia soggetto alla supervisione del Ministero delle Antichità egiziano in quanto edificio archeologico. E l'oblio dopo che è stato uno dei più importanti palazzi storici che hanno segnato la storia del Khedive Cairo.
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