Nell'anno 1924 d.C. Alcuni copti di Zaytoun pensarono di costruire una chiesa; poiché in questo grande sobborgo non c'era alcuna chiesa, ricorsero al defunto "professor Khalil Ibrahim" (Khalil Pasha Ibrahim). Era ricco e gli chiesero di donare un appezzamento di terreno per costruire la chiesa, e lui lo promise. Iniziarono a raccogliere donazioni, durante le quali il defunto "Khalil morì" Ibrahim". I copti hanno consegnato le 450 sterline raccolte al professor Tawfiq Khalil, figlio del defunto Khalil Ibrahim. Pertanto, mi impegnerò a suo nome a realizzare questo desiderio".
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Per quanto riguarda la superficie della Chiesa dell'Apparizione, si tratta di 250 metri quadrati, con cinque cupole, di cui la centrale a 17 metri di altezza, con finestre che si aprono sulla navata della chiesa e sormontate da una grande croce. Le altre quattro cupole, di dimensioni inferiori, si innalzano a 12 metri da terra e presentano aperture, ma non sono collegate alla chiesa. Il suo terreno è il tetto della chiesa.
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All'interno della chiesa si trovano molte icone della Vergine, degli angeli e dei santi. Nuove icone sono state disegnate con l'apparizione della Vergine Maria nella chiesa, come l'immagine della Vergine nella cupola principale della chiesa e alcune icone donate alla chiesa dall'imperatore Haileselassie in occasione della sua visita.
Dalla trasfigurazione della Vergine Maria in lei, gli abitanti della chiesa si contano a migliaia, dopo che la chiesa era stata progettata per ospitare al massimo venti membri di una famiglia.
Una delle benedizioni della Trasfigurazione della Vergine nella Chiesa è che il garage dell'Autorità dei Trasporti Pubblici di fronte alla Chiesa dell'Apparizione è diventato il luogo in cui è stata costruita una grande cattedrale, che ora è la seconda cattedrale più grande in termini di superficie in Medio Oriente. La prima pietra è stata posata da Sua Santità Papa Shenouda III giovedì 25 marzo 1976.
All'interno della chiesa sono stati costruiti un ospedale, case per anziani ed espatriati ed edifici di servizio.
Le chiese dell'Egitto copto sono luoghi indispensabili che devono essere visitati dai crocieristi che attraccano nei vari porti egiziani. Le nostre escursioni a terra in Egitto possono portarvi a trascorrere del tempo di qualità al Cairo durante le escursioni dal porto di Sokhna o anche se vi fermate solo in un altro porto, possiamo farle dalle escursioni a terra di Port Said.